项目根据国家有关精神和要求，采取事业法人单位管理，由武汉轻工大学主管，实验站实行站长负责制，财务单独核算制开展工作。

（1）运行机制

①用人机制

对管理与服务团队采用全员聘用制管理。根据业务工作的实际需要，科学、合理地设置工作岗位，明确岗位责任、任职条件、聘用期限，按照“公开、平等、竞争、择优”的原则进行选聘和竞争上岗。

②责任机制

在实验站管理方面，制定了包括实验站管理办法、实验站工作人员考勤管理办法、实验站场地管理办法等一系列规章制度，力求作到管理规范化、实验站工作科学化。实验站的试验仪器和设备由专人负责定期的维护和年检，数据资料也由专人负责记录和整理，以确保检测结果的准确性。在项目运行过程中，实行岗位责任制，健全“责、权、利”相统一的机制。

③激励机制

在分配制度方面，根据各机构的职责与任务，确定不同的工作目标，进行量化管理，实行按岗位和任务定酬，按业绩取酬，建立起按劳分配，多劳多得，奖优罚劣的分配制度和激励机制；根据工作需要，有计划地对工作人员进行技术培训，以充分发挥各方面人员的积极性，责权利结合，吸收和留住优秀人才。

④财务运行机制

实验站长期观测工作是公益性事业，与各项观测内容相对应的基础设施运行所必需的人员经费，样品采集、样品运输及样品测定、数据规范等，主要收入来源为国家、省市区科研经费。在健全的财务、审计制度下使用经费，资金的使用要严格按照国家财务管理办法执行。

（2）管理制度

①工作管理制度

项目依托自身的功能和条件，本着出成果、出人才、出效益、促进社会可持续发展的宗旨，积极探索适合项目特点的人事管理制度、运营管理制度和技术发展制度。并制定职工守则、安全守则、管理规章制度和奖、罚条例以及各部门职责等，努力创建加速技术创新、技术转化、技术推广和人才发展的良性循环机制。

②财务管理制度

项目运行在财务上实行独立核算并设置专业人员进行管理，严格执行《农业部重点实验室发展规划（2010-2015年）》（农科教发〔2010〕4号）、《农业部重点实验室管理办法》（农科教发〔2010〕5号）和财务经费使用的有关法规，实行专账管理，保证专款专用；按规定及时编制和上报财务年度执行情况和财务报表；自觉接受并配合审计部门的检查和财务审计。